O SSE – Serviço de Supervisão Escolar do Colégio Franciscano Sant'Anna tem como objetivo principal primar pela qualidade do processo educativo. Coordena a elaboração, execução e avaliação do Projeto Político Pedagógico de acordo com a filosofia do Colégio Sant'Anna. Atenta as necessidades de cada tempo, exerce atividade permanente de diagnóstico, acompanhamento e avaliação do processo ensino e aprendizagem.
Acompanha e assessora as coordenações pedagógicas e os professores no processo de formação continuada voltado ao estudo, reflexão, cultivo de valores, aprofundamento da filosofia franciscana e de temas relevantes a construção da pessoa e do profissional.